两者主要区别是干细胞的添加，干细胞自体脂肪移植一般采用脂肪干细胞结合自体脂肪来填充，干细胞是脂肪基础分化细胞，可以改善脂肪生存环境及自身转化为脂肪细胞。脂肪干细胞是近年来从脂肪组织中分离得到的一种具有多向分化潜能的干细胞，脂肪干细胞能够在体外稳定增殖且衰亡率低，同时它具有取材容易、少量组织即可获取大量干细胞，适宜大规模培养，对机体损伤小等优点，而且其来源广泛，体内储备量大，适宜自体移植。