头部毛囊萎缩的原因有很多，如外伤、感染、物理和化学因素等。有必要找出病因，然后进行针对性的治疗。前额脱发久治不愈的头发毛囊萎缩和由于斑秃长时间未愈导致的斑秃部位头发毛囊萎缩比较为严重，长时间头发毛囊萎缩比较终会导致毛囊坏死，毛囊坏死后无论用什么药物治疗都不会使毛囊再生，只有通过植发的方法让秃发部位重新长出头发。做植发应到正规的植发医院做，可以很好的改变秃发部位的形象，改善脱发人的气质，使得脱发的负面失衡的心理得以消除。

毛囊萎缩不可以进行植发。有毛囊萎缩的人群进行植发，会导致头发的存活率很低，会对植发的效果不好。毛囊萎缩通常是由于毛囊营养吸收出现障碍导致，可以到医院皮肤科对毛囊进行检查，并且在医嘱下涂抹维生素E来促进皮肤的营养，改善毛囊萎缩的现象。也可以对头皮进行按摩来促进局部的血液循环，可以起到改善毛囊萎缩的效果。