毛发种植手术的副作用是：手术对供区部位的皮肤有一定的损伤，可能会刺破皮肤，导致出血等现象，而且在操作过程中，需要做好消炎消毒工作，如果手术不够严谨，那么术后可能有感染问题，头皮出现疼痛肿胀的现象。手术是将毛发一株一株地植入到缺失部位的，操作过程比较精细，复杂，所以如果植入的毛发量不够均匀，手术后头发变得不够完整协调，为了降低手术副作用产生的几率，提高手术的安全性，求美者要注重对医院和医生的选择，建议选择技术水平高的医生操作，安全更有保障。