宫颈囊肿常常是由于宫颈鳞状上皮，在替代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮伸入到宫颈管腺口，或者是覆盖了宫颈腺管，将宫颈腺管口给堵塞，引起液体潴留而形成的囊肿，一般说来宫颈囊肿是属于生理性的病变，所以通常是不会癌变。只是在宫颈深部的纳氏囊肿需要与宫颈腺癌相鉴别而已，所以有宫颈囊肿的女性，也需要每年做一次宫颈tct的筛查来排除宫颈癌。