苯扎氯铵溶液主要适用于手术前皮肤、黏膜及伤口的消毒。苯扎氯胺溶液的使用方法为：皮肤消毒用0.1%溶液；黏膜消毒用0.05%的溶液；创面消毒用0.01%的溶液。高浓度品种可加无菌注射用水或新鲜无菌蒸馏水稀释至所需的浓度。苯扎氯胺溶液常见的不良反应为变态性结膜炎、视力下降。也有报道称，3%的溶液灌肠会导致死亡。