怀孕三个月右腹微疼可能是结肠炎，也有可能是十二指肠溃疡。如果出现结肠炎的话，可能会出现肠梗阻、肠穿孔等各种病症。建议要去医院做一个检查，明确病因，通过口服消炎药物或静脉注射消炎药进行消炎处理，口服一些头孢素，如阿莫西林等都具有良好的治疗效果。其次要注意不要吃辛辣油腻的食物，养成良好的饮食习惯，多注意休息，不要过度疲劳。