碱性磷酸酶广泛分布于人体的肝脏、骨骼、肾脏等组织，临床上测定碱性磷酸酶主要适用于骨骼以及肝胆系统疾病的诊断和鉴别诊断，特别在其出现升高时具有临床意义。而碱性磷酸酶偏低时一般没有太大的临床意义，如果没有临床症状，无需特殊处理，定期随访观察即可。当然某些疾病也可以造成碱性磷酸酶偏低，但多伴有不同程度的临床症状。如严重贫血、儿童期甲状腺发育不全、重症型慢性肾炎、维生素C缺乏症性坏血病、恶病质等等。