急性扁桃体炎可以是病毒感染，或者是细菌感染引起来的，发生时需要应用抗菌素以及抗病毒药物，抗菌素首先选择青霉素类或头孢菌素类。酌情使用糖皮质激素，能够有效的控制炎症，以及减轻局部的水肿，如果治疗效果欠佳，需要根据咽部细菌培养，选择敏感的抗菌素。高热以及咽喉部疼痛剧烈的患者，可以应用解热镇痛药。慢性扁桃体炎反复发作时，最好是能够手术治疗。