系统性红斑狼疮如果治疗不及时，到了晚期可以出现多种脏器的功能损害，比如累及肺脏可以出现狼疮性肺炎，肺间质纤维化，肺动脉高压，肺心病，累及肾脏可以出现狼疮性肾炎，肾功能衰竭。累及颅脑可以出现脑梗赛脑出血，癫痫发作，精神障碍。如果累及心脏可以出现，恶性心律失常心源性猝死，心衰等。长期应用大剂量激素治疗，还可以出现各种的感染。