感染乙脑病毒后，症状相差悬殊，大多无症状或症状较轻，仅少数患者出现中枢神经系统症状，表现为高热、意识变化、惊厥等。初期起病急，一般无明显前驱症状，可有发热、神萎、食欲不振、轻度嗜睡，头痛，婴幼儿可出现腹泻，体温在39℃左右，持续不退，少数患者出现神志淡漠，激惹或颈项轻度抵抗感。极期患者除全身毒血症状加重外，突出表现为脑损害症状明显。高热，意识障碍加重，由嗜睡转入昏迷，惊厥反复发作，甚至肢体强直性痉挛，昏迷程度加深。脑水肿及颅内压增高。呼吸衰竭。循环衰竭。高热、惊厥、呼吸衰竭是乙脑极期的严重症状，三者相互影响，尤为呼吸衰竭常为致死的主要原因。