上颌窦囊肿可分为两种类型。一种是粘液囊肿。多为单侧出现，囊肿增大的时候可累及周围结构，包括眼眶和颅底。出现眼部症状包括导致眼球移位，严重时压迫视神经及眶上裂，出现视力减退，眼肌麻痹，眼部感觉障碍和疼痛如果囊肿出现继发感染，会发展成为脓肿，其破坏性，会明显增大。另一类被称作粘膜囊肿。这一类危害性较小，生长较为缓慢，并且可在长到一定程度自然破裂。上颌窦囊肿一般不会恶变。