甲状腺发炎并不像我们通常了解的其他的炎症一样，像肺炎，扁桃体炎等是一个感染性的炎症。甲状腺炎大多数是无菌性的炎症，或者更准确的说是自身免疫性的炎症。只有极少数是因为感染所引起的化脓性甲状腺炎。具体的甲状腺炎的病因及发病机制目前并不是特别清楚，多数认为与遗传或者自身免疫相关因素有关系，少数可能与病毒感染后机体变化有一定的相关性。