头疼做CT还是磁共振要根据根据头痛的性质以及伴随的症状来判断，首先，如果头痛比较剧烈，早期出现喷射性呕吐、意识的改变，这时考虑脑出血的可能，那么做头颅的CT比较好。对于判断脑出血CT好过核磁共振，如果头痛反复发作，突然一侧肢体的麻木和无力，时间在6个小时之内，考虑急性梗塞的可能，核磁共振可以发现超早期的梗死。如果是小脑脑干、后颅窝的病变受骨质的影响，CT比较模糊，核磁共振检查比较好。