新生儿角膜炎时会表现为不敢睁眼（尤其在光线强的时候）、眼里泪汪汪的（有时眼泪会顺着眼角流出来）、眼睛发红（一般是：越靠近角膜结膜充血越明显），角膜上会有浸润点或浸润区（表现为角膜局部混浊、水肿、不透明）、有的在浸润区表面有分泌物。另外，角膜炎会引起不同程度的视力下降（如病变位于中央光学区，则视力下降更明显，但新生儿不会表达）。