目前还缺乏能够改善自闭症病程改善核心症状的药物。如果患者伴随的精神神经症状明显，或威胁到自身或他人安全，或严重干扰患者接受教育和康复训练、影响日常生活，可使用相应药物对症治疗。利培酮能改善自闭症患者的自伤行为、攻击行为和破坏行为以及幻觉、妄想等精神病性症状。对于合并注意缺陷和多动症状的自闭症患者可以选择哌甲酯、托莫西汀等，非合并癫痫发作的患者可以使用丙戊酸、奥卡西平等抗癫痫药物。