扁桃体发炎有急慢性之分。急性扁桃体炎的病因，大多为乙型溶血性链球菌感染。但葡萄球菌，肺炎链球菌，腺病毒等也可引发急性扁桃体炎，在临床上细菌和病毒混合感染者也较为多见，甚至有厌氧菌感染的病例。当人体受凉，空气湿度过大，过度疲劳，烟酒过度或接触了有毒有害的气体和粉尘等可导致全身或局部的抵抗力降低，病原体就会侵入人体内，或大量繁殖而导致致病。慢性扁桃体炎大多由于反复发作的急性扁桃体炎导致细菌在扁桃体隐窝内繁殖而诱发。一些急性的传染病，比如猩红热，白喉，流感，麻疹等，也可引发慢性扁桃体炎。