胚胎停育也是自然流产的一种，常见原因在临床中主要有6个方面，1.感染因素。支原体感染，胚胎停止发育的次数与支原体，衣原体感染(+)率呈正相关。亚临床支原体感染是自然流产，特别是反复流产的重要原因。2.内分泌因素。由内分泌失调所致的胚胎停止发育，在早期自然流产中，占23%-67%。3.免疫因素，受精卵在母体的种植，可视作是一种半同种移植现象。4.遗传因素染色体异常。由于染色体的数目或结构异常所致的胚胎发育不良是引起自然流产的常见病因。在早期妊娠自然流产中核型异常的发生率高达60%-70%。尤其是怀孕头3个月内的流产，如果女性年龄大于35岁，卵子老化，易发生染色体不分离，导致染色体异常。5.环境因素，可导致胚胎停育的有毒物质、放射性物质、高温等，这些有害因素导致胚胎遗传物质发生致死性突变和损伤而流产。酗酒、女性吸烟等也可造成流产、胚胎停育。6.男性因素。以往这些因素常常被人们忽略，其实精液因素、精液不液化、精子畸形率高、精子活力低、精子凝集等男性因素都可以引起流产。据临床观察，其父菌精症，约占10%-15%。男性生殖道内无症状的感染精液中既含有一定数量的细菌、病毒、沙眼衣原体、解脲支原体等这些感染可削弱受孕妇女的孕育能力，而致使胚胎流产。活动的精子在完成“生命之吻”时也会将续细菌带去，这就会干扰精卵结合与着床。所带的细菌多为粪链球菌、白色葡萄球菌、大肠杆菌、厌氧性细菌等。