儿童呼吸衰竭常见的原发疾病包括呼吸道阻塞性疾病，比如气管异物吸入，急性喉梗阻，喉痉挛，血管环压迫，咽喉壁脓肿，气管软化等。肺实质病变，比如各种病原体导致的肺部感染，肺水肿，急性呼吸窘迫综合征，哮喘急性发作，气胸等。呼吸泵功能异常，包括中枢呼吸中枢，脊髓，呼吸肌，胸廓各部位的病变，比如脑炎，脑膜炎，颅内占位的病变或者出血，胸部外伤，脊髓炎，先天性心脏病，重症肌无力，吉兰巴雷综合征，中毒等。