引起角膜炎的原因有多种。其中病原微生物（细菌、病毒、真菌、支原体等）是引起角膜炎的常见原因，往往会伴有角膜外伤史（如角膜异物史及取出史、角膜擦伤、不正确的使用角膜接触镜等）。其他的原因有：一些自身免疫性疾病（也会引起角膜的炎症）、邻近组织炎症的蔓延（如有些类型的结膜炎会累及角膜，引起角膜炎）、眼睑闭合不全可引起暴露性角膜炎等。