慢性肛窦炎临床主要症状是排便时肛门疼痛，并且位置不能明确。如果反复发作，严重时会出现肛门异物感，并且肛管下坠感和肛管肛门脓性分泌物增多。临床上还有合并肛乳头炎和肛乳头肥大等症状。目前需要局部注意局部清洁卫生。可以应用高锰酸钾温水坐浴或者复方荆芥熏洗剂熏洗1天2次。可以口服抗炎药物治疗如盐酸左氧氟沙星胶囊和甲硝唑片等，保守治疗无效，严重者可以采取手术治疗。