小耳畸形的治疗方法主要是小耳畸形再造手术。小耳畸形再造又分为自体材料再造和人工材料再造，需要根据患者的病程病情不同进行选择；

小耳畸形自体材料再造术

取自体肋软骨进行雕塑，组合成外耳轮廓，形成耳廓支架，对残耳皮肤进行合理转位，保留耳垂，最后将已塑型的耳支架埋植于残余耳后皮下。半年至一年后再行二期手术，立耳、重建耳颅角。优点是再造耳廓形态逼真、轮廓清晰，有血供、有感觉，可承受睡觉时的正常压迫。缺点是需要肋软骨的数量较多，至少两到三根，患者痛苦大，有发生气胸、胸廓畸形等并发症的可能,而且必须分期手术，患者需承受两次手术的痛苦。还要就是移植的肋软骨有吸收变形的可能，从而影响外形。

小耳畸形人工材料再造术

Medpor是一种医用极高密度多孔聚乙烯(high density porous polyethylene)生物材料，内含许多互相贯通的孔隙。Medpor耳支架稳定性强，含有纵横交错的孔洞，可使新生组织快速长入，并与长入组织共同形成稳定的复合物，具有成形好，外观逼真，耳廓各细微结构显现清晰，不易变形等优点。缺点是存在一定的组织排异率，质地较硬、弹性差、有因受压或创伤而外露的风险，不过可以利用局部皮瓣和带血管的筋膜瓣的覆盖来减少，此种材料价格稍显昂贵。