胆汁反流主要是造成胃部烧灼感、上腹部疼痛、腹胀、恶心、呕吐、嗳气、食欲减退、排便不畅等消化道症状。长期反复胆汁反流还会引起溃疡，出现消化道出血、穿孔、幽门梗阻，甚至癌变。消化道出血的临床症状呕血和黑便，主要还是根据出血的量和速度来决定。穿孔时可以表现为剧烈腹痛，难以忍受，大汗淋漓，强迫体位，腹肌呈板样强直，肠鸣音减弱或消失。幽门梗阻时表现为频繁剧烈呕吐，呕吐物还有隔夜食物，伴有酸臭味。而癌变的患者还会出现贫血、消瘦、甚至恶病质等。