手术后打针没有副作用。是有帮助的主要使用的注射药物就是雌孕激素调理内分泌功能或者是抗生素避免感染。因为巧克力囊肿也称为子宫内膜异位症也就是正常的子宫内膜改变了位置进入到卵巢的位置导致的这个囊肿形成，月经期间出血量大会有疼痛非常剧烈，如果不手术治疗危险的情况会引起肿瘤癌症的高发，手术后选择药物可以控制该疾病的复发也可以调理正常的月经和卵巢的排卵功能。