肛门检查在诊断肛肠疾病中非常重要，首先应该视诊，触诊。观察肛周及肛门有无肿物脱出，有没有肛瘘，粘液，脓血，粪便，溃疡等。如果有肛瘘可见瘘管外口并有脓性分泌物，直肠脱垂有直肠粘膜脱垂脱出，血栓性外痔可见暗紫色圆形肿块。触诊可以应用石蜡油涂抹后缓慢插入肛门，观察肛门周围有无触痛，肿块，狭窄等。肛门镜检查排除有没有溃疡性直肠炎，直肠肿瘤，异物等。